More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0424 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 209 aa  235  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 215 aa  226  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 218 aa  224  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 218 aa  224  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 218 aa  224  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  55.9 
 
 		 202 aa  224  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  51.44 
 
 		 204 aa  214  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 209 aa  141  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  43.6 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 226 aa  118  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 225 aa  94.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  26.29 
 
 		 237 aa  89  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  30.05 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  30.72 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  30.32 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  25.59 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  29.09 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  26.88 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  25.21 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  48.21 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>