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for query gene Tbis_3212 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
223 aa  461  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1152  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 
203 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  30.06 
 
 
199 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  28.23 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
209 aa  61.6  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 
201 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 
291 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
222 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 
194 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  28.47 
 
 
209 aa  59.3  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
196 aa  58.9  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0246  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
189 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  44.87 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  44.87 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  43.48 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
173 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
280 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
201 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 
203 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
234 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 
215 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  24.03 
 
 
204 aa  55.5  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 
201 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 
226 aa  55.5  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 
227 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
196 aa  55.1  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
228 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  50.98 
 
 
278 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2809  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
173 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  45.61 
 
 
198 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
190 aa  55.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
173 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  29.37 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  24.76 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 
205 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
446 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 
207 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  32.79 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal 
 
 
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NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
196 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.831854 
 
 
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NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.102981 
 
 
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NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
195 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 
196 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.856697 
 
 
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NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
202 aa  52.8  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
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NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_9297  putative transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 
198 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775461 
 
 
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