More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13360 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
215 aa  438  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  62.02 
 
 
225 aa  261  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  61.72 
 
 
211 aa  259  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  63.27 
 
 
245 aa  257  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  61.06 
 
 
218 aa  254  8e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 
231 aa  250  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  60.68 
 
 
205 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  60.59 
 
 
215 aa  245  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  60.29 
 
 
271 aa  244  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  60.71 
 
 
221 aa  244  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  57.84 
 
 
227 aa  243  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  59.02 
 
 
216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  56.87 
 
 
330 aa  242  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  58.33 
 
 
226 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  60.91 
 
 
200 aa  240  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  57.43 
 
 
218 aa  234  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  57.35 
 
 
204 aa  234  8e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  58.67 
 
 
205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  56.8 
 
 
217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  57.58 
 
 
197 aa  231  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  57.36 
 
 
199 aa  230  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  54.85 
 
 
212 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  54.85 
 
 
212 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  54.85 
 
 
212 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  58.5 
 
 
317 aa  228  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  56.57 
 
 
197 aa  226  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  55.61 
 
 
273 aa  225  4e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  56.85 
 
 
207 aa  220  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  54.98 
 
 
220 aa  213  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  52.74 
 
 
220 aa  210  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
215 aa  98.6  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
238 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 
221 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
228 aa  88.2  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  32.14 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 
209 aa  84.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 
216 aa  85.1  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 
222 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 
195 aa  79  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  31.94 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 
218 aa  74.7  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
224 aa  72  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 
275 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  29.3 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  26.73 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  49.21 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 
231 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 
211 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
211 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
209 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
237 aa  61.6  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  30.14 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>