More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1286 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  87.88 
 
 		 204 aa  363  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  62.44 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 245 aa  248  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  60.1 
 
 		 197 aa  241  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  59.49 
 
 		 211 aa  241  7e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 197 aa  238  4e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  58.97 
 
 		 271 aa  238  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  58.08 
 
 		 212 aa  237  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  58.08 
 
 		 212 aa  237  8e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  58.08 
 
 		 212 aa  237  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  57.95 
 
 		 218 aa  236  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  57.87 
 
 		 330 aa  234  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 200 aa  234  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  57.36 
 
 		 215 aa  230  9e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  56.41 
 
 		 231 aa  229  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  55.28 
 
 		 205 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  57.44 
 
 		 227 aa  225  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  55.61 
 
 		 216 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  55.9 
 
 		 205 aa  224  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  57.95 
 
 		 226 aa  224  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  56.92 
 
 		 221 aa  224  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  57.51 
 
 		 207 aa  220  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  55.1 
 
 		 218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  56.85 
 
 		 220 aa  218  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  55.78 
 
 		 215 aa  217  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  52.55 
 
 		 273 aa  214  5e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  54.87 
 
 		 317 aa  209  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  53.61 
 
 		 220 aa  203  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  34.18 
 
 		 237 aa  94.7  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 215 aa  87.8  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 216 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  50.91 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  26.4 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  24.35 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  25.65 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 257 aa  58.2  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  28.26 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>