181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2936 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 266 aa  522  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  59.91 
 
 		 218 aa  228  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  55.09 
 
 		 211 aa  215  7e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  56.37 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  53.07 
 
 		 238 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 253 aa  171  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  42.86 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  44.62 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 213 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  37.26 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 275 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  35.55 
 
 		 217 aa  99.4  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21260  transcriptional regulator, tetR family  32.86 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.646658  normal  0.296128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  30.56 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 246 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 246 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 246 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 194 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  32.84 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 200 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 199 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 227 aa  62  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  26.96 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  26.44 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  29.02 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  29.08 
 
 		 220 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 216 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  26.74 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 		 230 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 205 aa  52.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 218 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  34.58 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 220 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 179 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1198  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 224 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 199 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  21.83 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 206 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  29.06 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  34.94 
 
 		 194 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 212 aa  46.6  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2369  DNA-binding transcriptional repressor FabR  27.06 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123396  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 215 aa  46.2  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  33.73 
 
 		 201 aa  46.2  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  32.29 
 
 		 202 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 210 aa  46.2  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 229 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  29.23 
 
 		 205 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>