More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1537 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  524  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 203 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 215 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 200 aa  89.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 205 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 215 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 203 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 234 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 222 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  31.58 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 203 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  25 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  28.65 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  31.82 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  25.59 
 
 		 206 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 203 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  26.2 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  30.39 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  30.32 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  30.18 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3543  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0364286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  22.66 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 219 aa  62  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 216 aa  62  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 206 aa  62  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 195 aa  62  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  26.47 
 
 		 227 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 212 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 198 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>