270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0688 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 214 aa  84.7  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  35.66 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  34.01 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 219 aa  72  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  30.21 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  32.18 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  31.48 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  32.51 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  34.84 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  26.9 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  27.74 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  30.69 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 307 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3567  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.409379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  29.71 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 264 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 243 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0641  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 232 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 232 aa  51.6  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>