279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6428 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 217 aa  434  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  52.04 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  43.72 
 
 		 212 aa  131  9e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 243 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  38.07 
 
 		 206 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 222 aa  111  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  40.76 
 
 		 193 aa  106  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  40.8 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 231 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  34.22 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  32.69 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  42.69 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 167 aa  73.9  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  32.34 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  28.48 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  30.27 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  29.09 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 333 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0120  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.654836  normal  0.0157031 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  31.9 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0174  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  20.61 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  30.52 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>