More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1613 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  100 
 
 		 221 aa  443  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  50.25 
 
 		 238 aa  182  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  89  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  31.53 
 
 		 196 aa  85.5  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 295 aa  81.6  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  35.5 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  62  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  32.1 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  33.13 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  25.32 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  33.53 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  31.58 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  40.95 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 291 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  41.41 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  27.33 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
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NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
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NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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