221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6844 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  96.06 
 
 		 203 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 205 aa  201  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6157  TetR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 190 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2056  TetR family regulatory protein  27.93 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1663  regulator AmrR  27.93 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0318  TetR family regulatory protein  27.93 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0868367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1888  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  27.93 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1902  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  27.93 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00105547  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0842  regulator AmrR  27.93 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.063166  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 770 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  21.46 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 256 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  26.83 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2446  regulator AmrR  27.37 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584689  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  30.26 
 
 		 190 aa  51.6  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1519  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1542  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  27.44 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0160  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 227 aa  48.5  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  27.18 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 233 aa  48.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  23.31 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0174  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1617  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223446  normal  0.0770376 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1597  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703325  normal  0.531377 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 421 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  30.38 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 288 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  28.97 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1621  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4185  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4766  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1141  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412477  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0668  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109249  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37080  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  45.16 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 257 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  28.33 
 
 		 184 aa  45.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>