More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0262 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  386  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  42.6 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  41.28 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 203 aa  111  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  40.11 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  40.12 
 
 		 224 aa  101  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 194 aa  101  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 		 202 aa  99.4  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  43.11 
 
 		 190 aa  95.1  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  34.3 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  42.68 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 234 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  38.01 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 236 aa  91.7  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 		 207 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  41.32 
 
 		 222 aa  89.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 184 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 184 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 184 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 181 aa  87.8  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 203 aa  84.3  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  35.09 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  37.72 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  35.08 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  46.85 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  30.05 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  34.48 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  45.05 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  35.4 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
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NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
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NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
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NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
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NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
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NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  38.71 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
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NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
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