241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2596 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  438  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  55.11 
 
 		 276 aa  234  8e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  52.65 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  51.3 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  50.86 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  51.07 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  46.44 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  48.28 
 
 		 241 aa  187  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  49.34 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 225 aa  171  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  44.89 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  41.4 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  43.5 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 261 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  42.16 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  41.23 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  39.9 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 223 aa  121  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  40 
 
 		 251 aa  118  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  34.67 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 254 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 241 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  32.32 
 
 		 227 aa  98.6  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 240 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 248 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 255 aa  95.9  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 243 aa  93.2  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  30.6 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  25.1 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 244 aa  72  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  45.26 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  36.89 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  25.98 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  33.33 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  27.68 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  24.3 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  26.13 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  28.44 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  34.07 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  31.58 
 
 		 260 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 285 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>