More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2448 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  431  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  53.54 
 
 		 201 aa  240  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  55.44 
 
 		 208 aa  237  8e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
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NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  37.3 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 192 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 199 aa  99  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 222 aa  98.2  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 196 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 240 aa  94.7  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 222 aa  93.2  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  31.03 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 239 aa  92  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 236 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 184 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 234 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 224 aa  87  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 234 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
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NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
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NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
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NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  40.37 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
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NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
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NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  32.6 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 223 aa  72  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  26.82 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  26.82 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  24.62 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  29.38 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  30.91 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0172  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_0172  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194351  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  28.98 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
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NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
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NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
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NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
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NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
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NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  23 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
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NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
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