More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2172 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  416  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  45.73 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  42.64 
 
 		 199 aa  165  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 209 aa  99.8  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 248 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  32.16 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 202 aa  91.7  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  43.36 
 
 		 307 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 333 aa  89.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 200 aa  89  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  88.6  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 200 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
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NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  26.79 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  27.13 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
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NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
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NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  22.8 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
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NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
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NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  27.75 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  33.64 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
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NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  24.86 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  31.43 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_1609  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
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NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
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NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
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NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
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NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
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NC_010001  Cphy_1838  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
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NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  26.16 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  21.32 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
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