More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2260 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  100 
 
 		 199 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 197 aa  221  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  44.39 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  42.64 
 
 		 199 aa  165  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  42.41 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 208 aa  111  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 248 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  23.46 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  24.58 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  21.89 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  22.11 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  24.86 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  22.09 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  22.4 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0132  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  30.11 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  20.25 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  33.71 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  21.39 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  23.44 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  28.43 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  20.73 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3682  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  25.55 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  21.82 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 254 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 240 aa  52.4  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  23.45 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>