More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05790 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  422  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  40.36 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  41.96 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  48.41 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  38.99 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  35.12 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 232 aa  101  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  41.96 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  44.26 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  34.8 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  38.28 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 235 aa  89  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  41.35 
 
 		 244 aa  86.7  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  29.77 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  33.18 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  30.54 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 191 aa  62  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  24.79 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  24.19 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0676  putative transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  45.61 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  30.84 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0734  putative transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  35.54 
 
 		 180 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  24.65 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  35.54 
 
 		 180 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0142024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 333 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 180 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 248 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 191 aa  52  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  36.61 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0500  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1074  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  30.46 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5105  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 295 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>