More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1074 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1074  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1856  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 207 aa  51.2  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 228 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 246 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 250 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 218 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 278 aa  48.5  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 224 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 218 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 218 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 224 aa  48.5  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  25.42 
 
 		 187 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4972  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 317 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  23.08 
 
 		 199 aa  47.8  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 216 aa  47.8  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1950  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  21.88 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  21.97 
 
 		 203 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  25.19 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  27.07 
 
 		 510 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 245 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  23.17 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  23.65 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  30.77 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 286 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 223 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  23.19 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>