108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0734 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0734  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0676  putative transcriptional regulator, TetR family  94.53 
 
 		 205 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4515  transcriptional regulator, TetR family  41.09 
 
 		 217 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4581  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 215 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0138954  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1636  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0668  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109249  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0174  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4185  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0172  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0172  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1500  regulatory protein TetR  29.95 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.570959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1779  regulatory protein TetR  29.95 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0193  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1501  regulatory protein TetR  30.59 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856799  normal  0.774912 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0121  putative transcriptional regulator, TetR family protein  27.01 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.778342  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1344  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3021  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01438  hypothetical protein  23.3 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1003  putative HTH-type transcriptional regulator  21.55 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  23.86 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  25.42 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1605  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72373  hitchhiker  0.0000763584 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  27.04 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  22.67 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0132  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  20.4 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  21.59 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0186  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.240473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  22.78 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  31.48 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  22.98 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  26.38 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 239 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  23.17 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 214 aa  44.7  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  21.33 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 333 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  19.77 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  25.73 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  23.43 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  23.08 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  25.44 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  27.43 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  21.23 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1751  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000599302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  27.35 
 
 		 307 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 213 aa  42  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 214 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 207 aa  42  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 225 aa  42  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 237 aa  41.6  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  26.13 
 
 		 210 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 211 aa  42  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 209 aa  41.6  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 238 aa  41.6  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 220 aa  41.6  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>