43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1751 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1751  transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  427  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000599302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0387  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 174 aa  95.5  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1611  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1190  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0672  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1762  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4581  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0138954  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2869  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10300  transcriptional regulator, tetR family  25 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 307 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 333 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4515  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0676  putative transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 203 aa  44.7  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0734  putative transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  25.96 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  24.32 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2498  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  30.49 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  20.79 
 
 		 219 aa  42  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 209 aa  41.6  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  32.43 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  27.55 
 
 		 200 aa  41.6  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  33.85 
 
 		 192 aa  41.2  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 217 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>