145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4321 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  100 
 
 		 194 aa  370  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0961  TetR family transcriptional regulator  58.76 
 
 		 202 aa  187  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1071  regulatory protein, TetR  58.06 
 
 		 202 aa  184  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0689162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  34.83 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  34.12 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  22.34 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  38.4 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  33.92 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  33.92 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  34.12 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  34.12 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  34.12 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  31.74 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  32.93 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  33.83 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  32.34 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  32.34 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  32.34 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  32.34 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  32.34 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  32.34 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  32.34 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  32.97 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  24.1 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 216 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  31.58 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  25.29 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  38.39 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  24.88 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  24 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  25.62 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  31.34 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  25.75 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1121  transcriptional regulator BetI  24.57 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  23.35 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  27.64 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 206 aa  47.8  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 207 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  31.45 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  26.63 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  26.63 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2915  transcriptional regulator BetI  26.06 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  26.63 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  26.63 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 357 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  25.32 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  27.06 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  26.63 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  26.63 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0734  putative transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  26.04 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  25.15 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>