More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0395 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  360  4e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 204 aa  74.3  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5105  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  27.11 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  28.42 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  24.31 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  22.58 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  25.29 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  23.75 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  30.53 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 207 aa  62  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  21.51 
 
 		 208 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  24.07 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0237  transcriptional regulator  27.44 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000134845  hitchhiker  0.00000000249443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  22.48 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 425 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  27 
 
 		 206 aa  57.4  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  24.22 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  26.37 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  28.7 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  25.81 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  23.65 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  21.23 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  27.72 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  29.29 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 236 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 207 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4515  transcriptional regulator, TetR family  23.21 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  27.82 
 
 		 202 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  21.57 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>