More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0778 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  406  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 192 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  46.36 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  44.14 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  38.05 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  41.44 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  37.61 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 201 aa  72  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  31.03 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  27.6 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  29.24 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  30 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  36.54 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  29.9 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  29.3 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  27.27 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  27.61 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  25.7 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  45.78 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  28.43 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  24.7 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  27.78 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
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