More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6886 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
239 aa  472  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  83.12 
 
 
236 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  80.93 
 
 
234 aa  349  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  79.57 
 
 
237 aa  344  8e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  79.24 
 
 
235 aa  343  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  79.24 
 
 
234 aa  341  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  83.8 
 
 
236 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  64.11 
 
 
211 aa  256  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  51.47 
 
 
203 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  52.74 
 
 
205 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  52.74 
 
 
205 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  52.24 
 
 
205 aa  193  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  53.73 
 
 
205 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  50.75 
 
 
205 aa  190  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  49.01 
 
 
205 aa  185  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
216 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  41.83 
 
 
208 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
214 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  42.29 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 
208 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
225 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
222 aa  121  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 
201 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  37.82 
 
 
190 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
186 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  38.15 
 
 
207 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
204 aa  95.5  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  37.5 
 
 
206 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 
203 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 
206 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  31.15 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
208 aa  86.3  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
203 aa  85.5  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
184 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
184 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
240 aa  82  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
192 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  44.76 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  42.73 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  41.59 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
208 aa  79  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
234 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 
195 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  31.46 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  35.52 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  55.93 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  40.37 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
195 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
191 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1066  transcriptional regulator, TetR family  62 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.52451  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  36.15 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00920  transcriptional regulator, tetR family  35.96 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  34.1 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
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NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
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NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 
209 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
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NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
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NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  37.12 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
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NC_009664  Krad_2707  transcriptional regulator, TetR family  51.32 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
231 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0641  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010511  M446_2111  TetR family transcriptional regulator  37.71 
 
 
188 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.0160657 
 
 
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NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
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