More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1066 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1066  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
214 aa  409  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.52451  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
242 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 
201 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  45.51 
 
 
197 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  40.69 
 
 
191 aa  99  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  42.01 
 
 
211 aa  94.7  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
236 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  40.76 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  40.76 
 
 
190 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
237 aa  88.2  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 
203 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  37.95 
 
 
224 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  43.09 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  34.6 
 
 
234 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  40.94 
 
 
207 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
235 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  40.44 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  31.52 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  41.46 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
222 aa  79  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  36.2 
 
 
228 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 
208 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 
208 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  41.88 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  36.53 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  40.59 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
208 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
193 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  38.15 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  57.58 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  44.34 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
192 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
150 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2707  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  43.81 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  35.15 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  41.35 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  32.09 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  35.23 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 
196 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 
206 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
202 aa  62.8  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  22.22 
 
 
199 aa  62  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 
196 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00920  transcriptional regulator, tetR family  35.4 
 
 
240 aa  58.5  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
230 aa  58.2  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
231 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
225 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 
189 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
234 aa  54.7  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 
201 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  29.86 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>