More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2974 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
225 aa  430  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  81.69 
 
 
208 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  79.45 
 
 
228 aa  316  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  79.34 
 
 
208 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  74.32 
 
 
214 aa  296  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  75.71 
 
 
216 aa  295  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  45.15 
 
 
235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
236 aa  133  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
239 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  44.09 
 
 
236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  44.17 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  41.26 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
203 aa  122  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  35.71 
 
 
205 aa  105  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
205 aa  105  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  41.01 
 
 
199 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
205 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
205 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 
205 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
205 aa  98.2  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 
212 aa  88.2  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 
201 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
191 aa  82  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  35.8 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  40.18 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  29.47 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  34.58 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  31.32 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  33.33 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  37.74 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  31.69 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00920  transcriptional regulator, tetR family  38.39 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  31.47 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
206 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
208 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
257 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
218 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 
230 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 
196 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 
207 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  34.9 
 
 
221 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 
186 aa  62.4  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  21.05 
 
 
205 aa  62.4  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 
223 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>