More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0424 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  36.25 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  35.14 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  43 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 240 aa  72  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  41.9 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  29.89 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  42.72 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  36.77 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  42.74 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 223 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 150 aa  62  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  40.71 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  40 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  29.47 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  39.05 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  35.85 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  34.23 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  30.86 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4515  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  30.56 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>