More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3609 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 228 aa  438  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  46.09 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  41.75 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  42.08 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  40.81 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 278 aa  121  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  36.74 
 
 		 249 aa  118  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  41.58 
 
 		 241 aa  118  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  42.21 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  48.74 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 254 aa  111  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  38.32 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 226 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  35.83 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  38.42 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 234 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  34.6 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 235 aa  98.6  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  33.47 
 
 		 260 aa  96.7  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 261 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 247 aa  92  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  29.39 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  37.61 
 
 		 259 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 247 aa  85.1  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  31.28 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  27.47 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  30.17 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  21.74 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 181 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1640  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  29.73 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  25.67 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 226 aa  52  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  18.64 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  25.68 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 333 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1074  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 307 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4101  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  26.67 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>