More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1640 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1640  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4101  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1181  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000866899  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3894  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0933  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1816  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.41828  normal  0.136235 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  48.44 
 
 		 280 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2085  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.839417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  34.19 
 
 		 241 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  45.9 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 98 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 175 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  45.61 
 
 		 182 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 275 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 346 aa  48.9  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 216 aa  48.9  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 168 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 206 aa  48.5  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4102  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  29.73 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0509  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  37.04 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2069  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  31.9 
 
 		 206 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 184 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 184 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 190 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 184 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>