198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6613 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  511  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  54.82 
 
 		 232 aa  257  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  57.08 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  51.54 
 
 		 249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 236 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  38.84 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  38.97 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  36.24 
 
 		 227 aa  115  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  33.2 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 221 aa  105  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  36.29 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  35.47 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  28.26 
 
 		 239 aa  95.5  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  42.07 
 
 		 224 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  31.82 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  30.99 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 223 aa  85.1  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  27.13 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  28.44 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  29.06 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  27.23 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  29.29 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 333 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 307 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  30.63 
 
 		 199 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 206 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 224 aa  52.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 183 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  30.87 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 200 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 206 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 219 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 201 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  24.82 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 191 aa  49.3  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 238 aa  48.9  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 208 aa  48.9  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 214 aa  48.9  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>