More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2980 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 237 aa  62  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  54.72 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  38.2 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  38.2 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  31.07 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  32.12 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 438 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 324 aa  55.1  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1313  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  33.62 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  31.19 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>