More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2327 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4321  TetR family transcriptional regulator  92.42 
 
 		 199 aa  354  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.675467  normal  0.0583361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3703  TetR family transcriptional regulator  91.96 
 
 		 199 aa  353  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3776  TetR family transcriptional regulator  91.96 
 
 		 199 aa  353  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3716  TetR family transcriptional regulator  91.46 
 
 		 199 aa  351  4e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  62.44 
 
 		 234 aa  249  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  61.93 
 
 		 200 aa  240  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 		 201 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 		 201 aa  218  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 202 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 202 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 202 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0397  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0669765  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  61.11 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  29.59 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 216 aa  62  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  36.43 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22310  transcriptional regulator, tetR family  45 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  53.12 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  47.54 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0842  regulator AmrR  43.75 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.063166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2056  TetR family regulatory protein  43.75 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1902  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  43.75 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00105547  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1888  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  43.75 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0318  TetR family regulatory protein  43.75 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0868367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1663  regulator AmrR  43.75 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211549  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  27.68 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  27.68 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  50.79 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  50.79 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>