More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1659 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  99.03 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  92.2 
 
 		 206 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  92.2 
 
 		 206 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  92.2 
 
 		 206 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  90.73 
 
 		 206 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  91.71 
 
 		 206 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  72.2 
 
 		 212 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  72.2 
 
 		 206 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  72.2 
 
 		 206 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  72.2 
 
 		 206 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  72.2 
 
 		 206 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  66.18 
 
 		 205 aa  276  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  64.71 
 
 		 205 aa  272  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 206 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 187 aa  158  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 237 aa  92.4  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  33.66 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 202 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 204 aa  84.7  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4804  TetR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  59.7 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  48.81 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  41 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 307 aa  61.6  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4250  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  23.28 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  44.16 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3898  regulatory protein TetR  35.77 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  43.28 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  26.59 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
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NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
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NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
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NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
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NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.03 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.03 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
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