More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3898 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3898  regulatory protein TetR  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5540  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00941347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8904  putative transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0815  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0511  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  41.77 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  58.82 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  53.57 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  43.06 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  41.18 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  43.06 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2816  transcriptional regulator, TetR family protein  30.08 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  37.84 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  37.84 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  37.84 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  37.84 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  37.84 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  37.84 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  37.84 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 190 aa  51.6  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 290 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  26.9 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 232 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  37.88 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 291 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>