294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4885 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 217 aa  114  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 200 aa  95.1  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 248 aa  95.1  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 243 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  29.94 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  28.25 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 310 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3898  regulatory protein TetR  38.2 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  35.87 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.42 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  34.25 
 
 		 226 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  46 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  37.31 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  34.75 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 307 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 236 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 254 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 237 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0815  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 770 aa  45.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 255 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>