More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2746 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  371  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  100 
 
 		 186 aa  371  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  65.59 
 
 		 185 aa  255  3e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 497 aa  70.9  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  30.68 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  25.55 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1884  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.543413  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  29.07 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 332 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  22.79 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  47.06 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 770 aa  55.5  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  43.55 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  20.63 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  38.71 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 317 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  25.2 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  23.36 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 199 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  24.31 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 250 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>