More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3014 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4067  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4114  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3955  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.915843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4434  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4231  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4287  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 191 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3966  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 191 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2903  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 191 aa  138  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.281452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4342  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 191 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0910  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 191 aa  134  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00546748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4323  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4703  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  0.288801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3506  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0158634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  22.52 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1589  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  23.97 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0391  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.914065  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  30.51 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  34.48 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0417  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.582738  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  43.75 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 202 aa  51.2  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 198 aa  51.2  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 232 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  48.78 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0370  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  46.94 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  27.27 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3420  putative transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  51.11 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  45.1 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 291 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  47.83 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 219 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>