216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3420 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3420  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3421  putative transcriptional regulator, TetR family  60.85 
 
 		 215 aa  261  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1955  putative transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0176094  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4895  transcriptional regulator, TetR family  37.26 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1070  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 245 aa  62  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  21.68 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 244 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 263 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  34.02 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 242 aa  48.9  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5205  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.278778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 242 aa  48.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 239 aa  48.1  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 258 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  27.78 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 235 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 238 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 251 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0039  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618128  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 286 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 249 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 240 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4067  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  27.11 
 
 		 253 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 221 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3108  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 234 aa  45.1  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 218 aa  45.1  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 410 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  27.27 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>