More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4675 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 216 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1710  transcriptional regulator  56 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0688  transcriptional regulator  50.79 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0733  transcriptional regulator  42.65 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1759  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1859  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  21.86 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3467  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  26.96 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 190 aa  52  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1550  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147371  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 190 aa  51.6  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  22.09 
 
 		 190 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  22.09 
 
 		 190 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.99 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4215  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.99 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4281  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.439471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4442  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.99 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10234  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  21.47 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  21.47 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  23.17 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  25.37 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  35.38 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  28.3 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  30 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  30.53 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  29.76 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4876  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  22.47 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  22.38 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>