More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4750 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  89.4 
 
 		 217 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  88.02 
 
 		 217 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  83.87 
 
 		 258 aa  374  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  84.16 
 
 		 204 aa  344  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  49.05 
 
 		 219 aa  218  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  31.22 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 246 aa  85.1  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2483  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0489732  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  29.01 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  30.36 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3420  putative transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  24.61 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  46.05 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1072  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0604431  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  24.61 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  24.61 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  47.76 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  24.61 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  47.14 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  39.51 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1539  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  24.61 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  24.86 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  25.95 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  36.84 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4889  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  40.62 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  25.36 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  35.16 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>