More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2561 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  43.78 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  39.69 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
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NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1189  regulatory protein TetR  26.49 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  1 
 
 
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NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  29.14 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3493  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1818  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671958  normal  0.199135 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0185  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141931  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  42.62 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
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NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.84 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.84 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
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NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  46.3 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  46.3 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  27.16 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  29.63 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 258 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4569  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000147437  normal  0.0336832 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  45.1 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0836  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.177404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.84 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
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NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_4037  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.766436 
 
 
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NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
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NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
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NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
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