More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2820 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  43.78 
 
 		 203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
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NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1189  regulatory protein TetR  26.32 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3493  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  39.74 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0185  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141931  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  24.64 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4569  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000147437  normal  0.0336832 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5724  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1818  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671958  normal  0.199135 
 
 
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NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
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NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  38.71 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6653  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  0.0271875 
 
 
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NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010087  Bmul_5348  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
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NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5968  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.609129 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
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NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.97 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.97 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  27.22 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  40.23 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  35.29 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1426  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  43.86 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1537  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2692  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
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NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  20.73 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  27.15 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
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NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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