More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1731 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  413  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  72.08 
 
 		 200 aa  307  8e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  69.9 
 
 		 203 aa  293  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  64.95 
 
 		 198 aa  270  8.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  63.64 
 
 		 199 aa  270  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 196 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 243 aa  78.2  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  25.88 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 233 aa  74.7  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  27.89 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  23.83 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  26.79 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2692  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  22.68 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1426  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6653  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 230 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  0.0271875 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 250 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  25.93 
 
 		 240 aa  62  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  22.88 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  29.58 
 
 		 241 aa  62  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 271 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  27.94 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0799  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126774  normal  0.374704 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5968  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.609129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  26.51 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  23.17 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>