More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2095 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
210 aa  427  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  93.81 
 
 
210 aa  410  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  92.86 
 
 
210 aa  407  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  87.62 
 
 
210 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  87.62 
 
 
210 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  87.62 
 
 
210 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  87.14 
 
 
210 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  87.14 
 
 
210 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  84.76 
 
 
210 aa  353  6.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  84.29 
 
 
210 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  84.29 
 
 
210 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  84.29 
 
 
210 aa  352  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  84.29 
 
 
210 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  84.29 
 
 
210 aa  352  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  84.29 
 
 
210 aa  352  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  84.29 
 
 
210 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  86.46 
 
 
192 aa  348  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  85.94 
 
 
192 aa  347  9e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  56.73 
 
 
210 aa  256  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  56.73 
 
 
210 aa  252  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  54.85 
 
 
231 aa  244  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  54.37 
 
 
231 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  55.39 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  47.03 
 
 
216 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  49.17 
 
 
225 aa  197  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  45.77 
 
 
218 aa  194  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  45.37 
 
 
227 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 
225 aa  184  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 
225 aa  184  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 
215 aa  175  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  40.39 
 
 
241 aa  168  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  40.4 
 
 
223 aa  167  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  40.78 
 
 
233 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  41.55 
 
 
228 aa  165  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  43.41 
 
 
224 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  41.95 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  41.21 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 
224 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 
224 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 
232 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 
232 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 
232 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 
232 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 
232 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 
246 aa  158  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
220 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
225 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  40.3 
 
 
222 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  42.08 
 
 
240 aa  155  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
222 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  45.81 
 
 
241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
240 aa  154  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
214 aa  154  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  36.06 
 
 
227 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
211 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
224 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
224 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
224 aa  151  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 
212 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
235 aa  150  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 
242 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
224 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  38.42 
 
 
218 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
237 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
237 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 
223 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
248 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 
239 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
231 aa  148  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
227 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  43.93 
 
 
263 aa  144  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
212 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
212 aa  141  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  38.86 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 
251 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
226 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
243 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0125  TetR family transcriptional regulator  38.65 
 
 
238 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.493759  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  32.74 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 
225 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 
270 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2513  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
214 aa  122  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.988711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>