More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3894 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  100 
 
 		 206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  39.49 
 
 		 197 aa  121  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 230 aa  99.4  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 218 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 195 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 195 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 195 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  30.34 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 223 aa  72  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  37.14 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  32.12 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  32.53 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 238 aa  62  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  26.95 
 
 		 200 aa  62  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  27.91 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  30.05 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>