More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4942 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 247 aa  483  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  66.52 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  42.38 
 
 		 249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4005  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 242 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3790  transcriptional regulator, TetR family  38.21 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  41.12 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3567  transcriptional regulator, TetR family  40.76 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.409379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1892  TetR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0027  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 191 aa  86.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  33.94 
 
 		 206 aa  72  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  32.35 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 209 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  34.65 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 278 aa  52  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 239 aa  52  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19500  transcriptional regulator, tetR family  29.2 
 
 		 181 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1324  nucleoid occlusion protein  30.51 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 196 aa  50.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  46.88 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  46.88 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 192 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  46.88 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  55.32 
 
 		 220 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 207 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 199 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 209 aa  49.3  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 200 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 202 aa  49.3  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 202 aa  49.3  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 202 aa  49.3  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 225 aa  49.3  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 275 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2227  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 180 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192949  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 225 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  48.9  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 184 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>