More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0677 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 238 aa  475  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  51.74 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 231 aa  218  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  50 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  36.69 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 203 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 207 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  34.39 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  31.35 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 196 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  27.17 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  29.76 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 200 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  29.63 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2498  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 184 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 249 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  20.44 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>