62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2498 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2498  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 184 aa  373  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10300  transcriptional regulator, tetR family  50.85 
 
 		 200 aa  181  6e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0672  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1762  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0387  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1190  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1611  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 232 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 207 aa  48.5  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 230 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  42.59 
 
 		 207 aa  45.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1344  TetR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 231 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 226 aa  45.1  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1812  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 213 aa  44.3  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  45.1 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 243 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2750  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_004310  BR1381  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.637245  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 243 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1338  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00412049  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2789  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1751  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000599302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  55.32 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2493  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 221 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1515  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1711  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 219 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.678609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 210 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 218 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1495  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 219 aa  41.6  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 222 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  41.2  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 181 aa  41.2  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 222 aa  41.2  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5326  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 218 aa  41.2  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  48.78 
 
 		 216 aa  41.2  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 215 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 247 aa  41.2  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0360  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 215 aa  41.2  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 220 aa  40.8  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>