37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1762 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1762  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  400  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1611  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10300  transcriptional regulator, tetR family  27.33 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2498  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0672  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0387  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1751  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000599302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  32.79 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  25.27 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  48.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1190  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 234 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 208 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 207 aa  44.7  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4581  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0138954  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  25.42 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2869  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 192 aa  42  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  42  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 248 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 333 aa  41.2  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>