54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0387 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0387  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 174 aa  362  2e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1751  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 207 aa  95.5  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000599302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10300  transcriptional regulator, tetR family  30.18 
 
 		 200 aa  87.4  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0672  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1611  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1190  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2498  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1762  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 229 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  25.16 
 
 		 200 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  25 
 
 		 206 aa  52  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  22.44 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 243 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 234 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 231 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  20.86 
 
 		 239 aa  47.4  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 285 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  22.83 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 193 aa  45.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 267 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 239 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 206 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 179 aa  44.3  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  23.94 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 223 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  28.36 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 268 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 203 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  23.74 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 195 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  21.26 
 
 		 202 aa  42  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 195 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 195 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 237 aa  41.6  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 206 aa  41.6  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  30.16 
 
 		 213 aa  41.2  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 203 aa  41.2  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  22.89 
 
 		 201 aa  40.8  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>