More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0726 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  38.31 
 
 		 243 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 230 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  32.11 
 
 		 199 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1705  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  30.47 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  37.14 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 324 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  35.58 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1265  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  29.24 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  32.91 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  24.64 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 288 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 254 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 291 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 254 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 225 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 254 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 254 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 254 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 254 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 254 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  28.35 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1941  hypothetical protein  31.15 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 273 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 248 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2322  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>